由于藍綠藻的遍布十分的廣泛，遍及各地。是較早的光合作用釋放氧氣的生物重要存在，它可以有不少藍綠藻(如魚腥藻)可以直接固定大氣中的氮，可以提高土壤的肥力，為作物提供能量供給，使作物增產。還有的藍綠藻為人們身體提供必要的營養元素供給人們食用，比如著名的發菜和普通念珠藻(地木耳)、螺旋藻等，都是常見的人們餐桌上的藻類食品。